DC-DC电源干扰

目前手头有个DC/DC电源，干扰比较严重，请朋友们支支招，先大致说明下情况：
该DC/DC电源输入是12V（电池电压输入），输出7路，1路6V（做反馈），6路18V（做驱动输出），芯片用的是LM3478。
目前该DC/DC的问题是，对输入地有500mV以上的噪声，噪声频率就是DC/DC的开关频率，由于变压器工艺较差，目前通过变压器初级吸收滤波，延长驱动时间，以及开关管DS加吸收等，最后开关管的DS还剩一个25V左右的尖峰。
最大的问题是该震荡同时影响了我的控制电路，我的供电回路是这样的：电池电压---控制板---电源板，该12V同时为我控制板提供12转5V,3.3V等，最后再传到开关电源，等于我现在电源部分把控制部分干扰了，当系统跑起来时，外部输出电流增大时（6路输出驱动模块，模块输出通过导流条再驱动电机（72V电机，电池供电），此时电源板的输出功率是不变的，唯一变的就是导流条上的电流在逐渐增大），控制部分的干扰就被放大。
目前的接地处理是控制板的数字地与模拟地都通过电容接到外壳，电源板在控制板正下方，12V与地都是从控制板引过来，电源板未接外壳。
请问该如何有效屏蔽DC/DC的干扰？
试过很多方法都不理想，后来单独给电源板也引一个地出来接到外壳，噪声从500mV以上降到200mV左右。
静态下看似情况有好转，但当外部输出电流增大后，控制部分采样的干扰依旧被放大，随着外部输出电流的增大噪声也被放大，恶劣程度跟原先差不多。
求指教，为何在外部输出增大时，噪声会被放大，该如何解决，谢谢！